存在于一个遥远的年代，一个神秘的幻境之中的故事。ICO是一个头上长着角的少年，村里有个习俗，凡是头上长角的小孩必须带到一座海上的城堡当作祭品。在ICO 13岁生日的那天，三个神官带者他骑着马往城堡出发，在穿过一片森林后，他们看到一座耸立在海上的城堡，神官们带者ICO搭着小船來到了城堡的地下。

　　上了岸后，其中一个神官说道：“去把剑拿来。” 于是另一个神官走到一旁拿起了一把附带着黑暗魔力的大剑（游戏中称作魔剑），此时在一行人面前出現了两座相连的奇怪图腾雕像。拿着剑的神官走上前轻轻的把剑拔出剑鞘，突然，从剑身上发出了数道闪电，闪电打在雕像上使得雕像从中间一分为二，接着神官带着ICO走进了一个圆柱型的塔，打开开关，一行人缓缓的开始上升。来到一间充满了巨大石棺的大厅，只见其中一個缓缓的打开， 仿佛在对ICO说这就是你未来的家了。一个神官将ICO抱起來放进石棺中，而另一个神官說：“请不要恨我們，这一切都是为了村子。”

　　石棺的盖子缓缓盖上，神官们也相继离去了。被关在石棺中的ICO突然感到有如地震般的震动，此时恐惧开始笼罩在ICO的心头，同时求生的本能也开始发挥作用，ICO试着摇动着石棺。不知是石棺由于年代太久远了，还是由于ICO自身非凡的力量，整个石棺因为晃动而掉落到地上，盖子也震开了。ICO整個人掉到了地上，冲击力使得ICO一度失去了意识。在朦胧之中，ICO觉得自己走在一个巨大的螺旋阶梯上，顺着阶梯來到顶端，ICO看见了一个笼子，在笼子中产生了一个黑色的人影。ICO因为害怕而靠着墙壁，但一不小心被从墙壁中出現黑影將拖进了黑暗……

　　ICO张开眼睛，发现原来只是一个梦，环顾四方，发现只有自己在这个大厅中。ICO试着在四周查看，就此，ICO就此走上了逃亡之路……